明初，中书省为中央最高行政机构，明太祖朱元璋为了加强皇权，于洪武二十八年（1093）撤销中书省，丞相制度被废除，殿阁大学士，明代，设大学士若干人，替皇帝批答奏章，商承政务，官阶五品。如果兼任尚书、侍郎，则可以加官到一品，成为事实上的宰相，俗称“阁老”。
原中书省所辖的吏、户、礼、兵、刑，工六部（吏部：负责官吏的管理，考核，升迁等，户部：有十三个司，分别管理各地的收支与报销，礼部：主管国家凶吉大典，教育与考试，招待外宾，宴劳功臣等，兵部：管理天下军政（军令由五军都督府管理），刑部：管理天下刑名，工部：管理建筑、后勤、水利、制造等）直接对皇帝负责，
六部尚书实际上成为朝廷的最高的行政长官，尚书为各部正官，侍郎为六部中各部的副官。
六部各设尚书一人，直接对皇帝负责，尚书之下有左右侍郎（副部长）、郎中（司长）、主事等。
吏部尚书]掌管全国官吏的任免考选，是吏部的最高长官。明代是正二品，通常称为天官、冢宰、太宰。
户部尚书]户部的最高长官，主管全国的财政监督、民政事务。正二品官
户部侍郎]户部的副长官，为从二品
礼部尚书]主管朝廷中的礼仪、祭祀、宴餐、贡举的大臣，正二品
礼部侍郎]礼部副长官，从二品，
刑部尚书]掌管全国司法和刑狱的大臣，为正二品，
刑部侍朗]刑部副长官，从二品，
兵部尚书]统管全**事行政长官，正二品。
工部尚书]掌管全国水土工和的大臣，正二品，。
工部侍郎]工部副长官，从二品。
郎中]在六部中仅次于侍郎的官，是部内各司的主官，正五品。
员外]“员外”是定额以外添派的人，为五品。
3、督察院：
直属于皇帝的监察部门
下设左右督御史（正二品）、左右副督御史（正三品）、左右佥督御史（正四品）
都察院是明朝中央的司法行政监察机构，明朝部，院同治，院、部权并重，院长官都御史与尚书平级，为正二品。
再往下设十三道监察御史，分管每个省的检查工作（当时中国分十三个省）十三道监察御史与直
属于皇帝的六科给事中统称”科道”属于言官范畴。
监察御史]监察御史掌管监察百官、巡视郡县、纠正刑狱、肃整朝仪等事务。明代为正七品。
给事中]朝廷中经手章奏，稽察六部百司的官，正五品。
4、六科：
分为吏户礼兵刑工六科，每科设督给事中（正七品）、左右给事中与给事中（从七品）。
给事中品级虽低，权利很大，皇帝交给各个衙门办理的工作由六科每五天注销一次，如果有脱拉
或者办事不力的，六科可以向皇帝报告。六科还可以参与官员的选拔，皇帝御前会议，审理有罪
的官员。最为重要的是六科有封还皇帝敕书的权利，皇帝的旨意如果六科认为不妥可以封还，不
予执行。
5、五寺：
五寺是五衙门的简称，包括大理寺、太常寺、光禄寺、太仆寺、鸿胪寺
大理寺：相当于今天的法院，是全国最高上诉机关。与督察院、刑部构成了三法司，
大理寺卿]全国三大司法长官之一，正三品。掌握全国刑狱的最高长官。
太常寺：主管祭祀
太常寺卿]掌管宗庙祭祀之事的长官，正三品。
太常寺少卿]太常寺副长官，正四品。
太常博士]太常寺掌管祭祀之事的官员，正七品。
光禄寺：主管宴享
太仆寺（兵部在地方设立的牧养军马机构）卿2人。
太仆寺卿，太仆寺长官，主管传达王命、侍从皇帝出入、车马等职事，正三品。
太仆寺少卿，太仆寺副长官，正四品。
鸿胪寺：“胪”是传的意思，“鸿胪”是大传颂的意思。管招待外宾
鸿胪寺卿]唐代鸿胪寺卿既管朝廷的侍客，又管司仪，明代专管朝廷的朝会仪节，正四品。
鸿胪寺少卿]鸿胪寺卿的副职，正五品。
、詹士府：
詹士府是负责辅助太子的机构设正三品詹士一人，正四品少詹士一人，正六品府丞一人
詹士府设左右春坊，司经局，主簿厅
7、太医院：