各类潜艇按照担负任务不同，分成第一、二、三支队，统一由潜艇长官统辖，包括：
第一潜艇支队：辖有一等潜艇艘，编号分别为u0~u0
第二潜艇支队：辖有二等潜艇艘，编号分别为u20~u20
第三潜艇支队：辖有三等潜艇6艘：编号分别为u0~u6
除前述作战舰艇以外，北海军区还辖有医疗船艘，由王光熊少校担任舰长（原楚谦舰长），水文测量船艘，由方佑生少校担任舰长（原楚豫舰长）；布雷舰艘，由饶涵昌少校担任舰长（原楚泰舰长）。
在北海军区内还有旅级编制的海军陆战队，直属海军参谋部，出于对夏海强这个新式海军陆战队缔造者的尊敬，海军陆战队以夏海强为名誉队长，不设旅长，分设代旅长和副旅长。
代旅长：陈明礼上校
副旅长：周 天上校
参谋长：李晓佟中校
副参谋长：黄绍竑少校（黄绍竑是继白崇禧、李宗仁等人之后留学德国的，原本回国后分配在在总参做参议，阴差阳错被夏海强碰到，本想留着自己用，一狠心给安排去海军陆战队了）
一团长：吕冰岩中校
二团长：马专若中校
三团长：常婴芮中校
炮团团长：华备培中校
海军东海军区，分管北起青岛，南至福建附近洋面，以希望号为旗舰，以舟山、上海为主要基地。
司令：凌霄准将
副司令：王时泽上校（原运输舰队司令）
参谋长：杨启祥上校（原机动舰队参谋长）
副参谋长：王传炯中校（原楚同舰长）
参谋：周兆瑞、沈继芳、薛启华（均为少校军衔）
航空兵长官：张自忠上校（张自忠在东北时就和沈鸿烈结识，后来去了陆军航空部队，北海号成军后，陈英昊的注意力转向北海号，希望号缺乏优秀的航空指挥官，在沈鸿烈极力推荐下，被海军硬挖过来）
东海军区的主力是以希望号为核心的第二舰队，同样是9艘军舰，主要包括：
航空母舰艘
希望号舰长：张楚材上校（原希望副舰长）
三等巡洋舰4艘
风号舰长：陈绍宽上校（原应瑞舰长）
雨号舰长：程耀垣上校（原肇和舰长）
雾号舰长：朱天森上校（原海容副舰长）
雪号舰长：陈季良上校（原海筹副舰长）
一等驱逐舰2艘：植物级
菊号舰长：刘田甫中校（原冬号舰长）
竹号舰长：赵士淦中校（原飞鹰号舰长）
三等驱逐舰2艘
龙湍号舰长：苗炜蓝少校（原飞鹰副舰长）
鲸波号舰长：万昆和少校（原建威副舰长）
第五舰队同样是训练部队，主要包括艘军舰，分别为：
一等训练舰艘
华山号舰长：郑礼庆上校（原练习舰队副司令）
三等训练舰2艘
海筹号舰长：叶芳哲中校（原飞鸿舰长）
海练号舰长：陈复中校（原同安舰长）
第三、四雷击舰队的编成类似第一、二雷击舰队，各有军舰5艘：
二等驱逐舰2艘
西号舰长：魏子浩少校（第三雷击队领舰，原飞鸿副舰长）
北号舰长：许凤藻少校（第四雷击队领舰，原联鲸舰长）
第三雷击舰队：辖有二等鱼雷艇4艘，分别为辽兴、辽平、辽远、辽静（各鱼雷艇舰长略，均为中尉军衔），其中萨镇冰族侄萨师俊担任辽兴舰长。