也就是16SrRNA。</p>
这部分长度大约1500nt，不同物种略有差异，算是目前主流的九大新物检测步骤之一。</p>
《极灵混沌决》</p>
五分钟后。</p>
裘生抬起头，对徐云道：</p>
“老徐，准备好了，引物你觉得用啥？”</p>
徐云想了想，很快道：</p>
“1492R吧。”</p>
“好嘞！”</p>
半个小时后。</p>
裘生抬起头，打了个响指：</p>
“搞定，扩出来了，BLAST的密匙你有吧？”</p>
徐云朝他竖起一根大拇指示意干得漂亮，随后走到操作台边，噼里啪啦的输了一大串密匙。</p>
做过新种检测的同学应该都知道。</p>
16S相似度检测的界限其实有些模糊，因为不同分类群的检测相似度阈值是不一样的。</p>
比如有的是97%，有的是99%。</p>
只是在通常情况下。</p>
相似度超过97%的，就可以认为是一个物种。</p>
相似度低于97%的，就可以认为是不同物种，进行下一阶段检测。</p>
不过就是这样一种不太精细的检测手段，却依旧是很多新物检测迈不过去的一道坎：</p>
大部分样本在经过检测之后，都会发现相似度在99.99%以上，与其他某某微生物是同一物种。</p>
总而言之。</p>
这项技术在定属方面还是靠谱的。</p>
又过了一会儿。</p>
裘生一脸惊喜的抬起头，声音骤然拔高了几分：</p>
“老徐，相似度46.9%，46.9%！！”</p>
“毫无疑问，这是一类新物！”</p>
徐云认真的看了他一眼，确认道：</p>
“只有一种新物吗？”</p>
“没错，只有一种！”</p>
徐云若有所思的点点头，又道：</p>
“那就继续上磷脂脂肪酸和呼吸醌鉴定吧。”</p>
众所周知。</p>
新物鉴定一般都有九个流程：</p>
1、16S相似度。</p>
2、形态学观察。</p>
比如这个菌的形状、大小、鞭毛情况等等，还包括最适生长条件的确定。</p>
3、磷脂脂肪酸鉴定，这个具有属特异性。</p>
4、呼吸醌，也就是看一下占优势的呼吸醌是哪种，这个有种特异性。</p>
5、分子杂交，也就是测定基因组序列，草图就行，然后跟近源物种去比较。</p>
相似度超过70%是一个种，低于70%是不同物种。</p>
6、碳源利用情况，看一下能利用哪些碳源，一共有95种碳源的测试。</p>
7、API试剂盒鉴定，生理生化鉴定的一方面。</p>